HPV的多重感染或称重叠感染，是指在某一个体或某一种病变中感染或检测到两种或两种以上的HPV亚型。在一般情况下，HPV感染是单一亚型感染，但在临床研究中发现有较多的HPV感染是多种HPV亚型感染即多重感染，如在同一种尖锐湿疣病变中叫检出HPV6型和HPVll型，或可检出HPV6型和HPVl6型等研究发现妇女宫颈HPV的多重感染较为普遍存在。有资料表明两种HPV亚型或两种以上HPV亚型的多重HPV感染者波动于2％-71％之间，最多见的报道是10％~20％。王金花等报告宫颈HPV多重感染达44.9％，但以二重感染为主，同时也检测出三重、四重、五重等感染。研究认为尽管感染一种HPV亚型后仍有可能再感染其他HPV亚型，但正常只有一种HPV亚型与已知的疾病有关，这可能是因为肛门外生殖器组织细胞受到某一种HPV亚型感染并引起病变后即可抑制其他HPV亚型而不引起相应病变。