已经治疗去除疣体后，绝大部分病毒也随之被清除了。一些患者经常规治疗后易复发，是由于疣体周围邻近的皮肤粘膜中的病毒没有被彻底清除。但复发后还可再进行治疗，终归可以将病毒清除干净，不再复发。复发一般发生在治疗后半年之内，半年以后复发和传染的概率很小。

　　咪喹莫特对治疗亚临床感染、抑制潜伏病毒疗效显著。 用5％咪喹莫特霜，隔日1次，用药6~10小时后清洗，也可以有效降低复发率，这是激光等物理方法治疗无法做到的。